Il Proteoma Circolante del Cancro Della Mammella Ultra-Precoce: Studio Comparativo con Lesioni Benigne e Controlli Sani

Abstract

Introduzione: Il cancro al seno (BC) è il tipo di cancro diagnosticato più frequentemente a livello mondiale; perciò, l'importanza della sua diagnosi precoce tramite screening è indiscutibile. Rispetto alla biopsia tissutale standard, la biopsia liquida può offrire diversi vantaggi come la minima invasività, la possibilità di effettuare un monitoraggio longitudinale e di catturare l'intero secretoma del cancro, rappresentativo della sua eterogeneità. I recenti progressi nel campo della proteomica plasmatica hanno permesso di valutare migliaia di analiti da volumi di input ultra-bassi. Obiettivo della tesi: L'obiettivo di questa tesi è identificare nuovi biomarcatori circolanti del BC ultra-precoce analizzando il suo proteoma plasmatico. Metodi: Le proteine plasmatiche sono state valutate tramite proteomica basata su aptameri in una coorte di discovery composta da pazienti con BC in stadio I-IIA e donne con mammografia negativa. Le proteine con un'abbondanza significativamente diversa tra le due coorti sono state valutate in una coorte di test separata e cross-validate attraverso la proteomica basata su anticorpi. Risultati: Un totale di 7057 proteine è stato valutato nella coorte di discovery. Di queste, l'abbondanza della prostaglandina D sintasi ematopoietica (HPGDS) era significativamente inferiore nei pazienti con BC rispetto ai controlli sia nella coorte di discovery che in quella di test. La proteomica basata su anticorpi ha mostrato un'elevata coerenza nella valutazione dell'abbondanza di HPGDS. Conclusioni: L'abbondanza di HPGDS è inferiore nei pazienti con BC precoce rispetto ai controlli senza cancro. Sono necessari ulteriori studi per confermare i nostri risultati in coorti di pazienti più ampie e per indagare la fisiopatologia di HPGDS nell'insorgenza del BC.

Background: Breast cancer (BC) is the most frequently diagnosed type of cancer worldwide, making early diagnosis through screening critically important. Compared to standard tissue biopsy, liquid biopsy offers several advantages, including minimal invasiveness, the ability to perform longitudinal monitoring, and the capacity to capture the entire cancer secretome, reflecting its heterogeneity. Recent advancements in plasma proteomics have enabled the assessment of thousands of analytes from ultra-low input volumes. Thesis aim: The aim of the present thesis is to identify novel circulating biomarkers of ultra-early BC by analysing its plasma proteome. Methods: Plasma proteins were assessed through aptamer-based proteomics in a discovery cohort of patients with stage I-IIA BC and women with negative mammography. Proteins having a significantly different abundance between the two groups were further evaluated in a separate testing cohort and cross-validated using antibody-based proteomics. Results: A total of 7057 proteins were assessed in the discovery cohort. Of these, the abundance of hematopoietic prostaglandin D synthase (HPGDS) was significantly lower in BC patients compared to controls in both the discovery and testing cohort. Antibody-based proteomics demonstrated high consistency in the assessment of HPGDS abundance. Conclusions: The abundance of HPGDS is lower in patients with early BC compared to cancer-free controls. Future studies are required to confirm these findings in larger patient cohorts and to elucidate the role of HPGDS in the onset of BC.