"Profilazione molecolare dei Carcinomi Mucinosi dell'esofago e della giunzione Esofago-gastrica"

Abstract

I carcinomi mucinosi dell'esofago costituiscono un sottogruppo di neoplasie rare che possono presentarsi a carico dello stomaco e della giunzione esofago-gastrica dove sono più rari. La loro rarità e le peculiari caratteristiche istologiche sollevano domande cruciali riguardo alla loro biologia e al loro impatto sulla prognosi. Questi tumori sono caratterizzati da una marcata produzione di muco e sulla base di caratteristiche morfologiche specifiche (pattern di crescita, cellularità, componente a cellule poco coese) possono essere distinti in due sottotipi a differente prognosi: il carcinoma mucinoso muconodulare (CMM) e il carcinoma mucinoso invasivo (CMI), più aggressivo. Scopo dello studio è esaminare la profilazione molecolare e individuare eventuali signature molecolari distintive nel CMM e CMI. Sono stati selezionati 24 casi (14 CMM e 10 CMI), sottoposti a intervento chirurgico tra il 2014 e il 2021 in assenza di terapia neoadiuvante. Da una inclusione di materiale rappresentativa per ciascun caso sono state ottenute sezione per l'estrazione di DNA e RNA. L'analisi genetica è stata eseguita mediante il kit TruSight Oncology 500 (Illumina, Inc), che esamina eventuali mutazioni in 523 geni del DNA e 55 geni dell'RNA. Nel confronto tra i due sottotipi il Tumor Mutational Burden (TMB) è risultato significativamente più elevato nel CMM (p < 0,01), mentre non si è osservata differenza nella instabilità dei microsatelliti. Nel CMM si osserva un maggiore numero di varianti con significato patogenetico, con una prevalenza di varianti nei geni TP53, ARID1A/B, ARID2, ERBB2/3, FGFR (p < 0,01). Inoltre nel CMM si è osservata una maggior quota di amplificazione (p < 0,01) in particolare a carico degli oncogeni MYC e BRCA2. Nel complesso tali dati supportano l'ipotesi che il CMM ed il CMI siano neoplasie con signature molecolare diversa. E' in corso una valutazione bioinformatica e di prodotti di fusione genica per definire meglio la signature molecolare di queste neoplasie.

Mucinous carcinomas of the esophagus constitute a subgroup of rare neoplasms that can manifest in the stomach and the esophagogastric junction, where they are even rarer. Their rarity and unique histological features raise crucial questions regarding their biology and their impact on prognosis. These tumors are characterized by a marked production of mucus and, based on specific morphological characteristics (growth patterns, cellularity, loosely cohesive cell component), can be distinguished into two subtypes with different prognoses: mucinous muconodular carcinoma (MMC) and invasive mucinous carcinoma (IMC), which is more aggressive. The purpose of this study is to examine molecular profiling and identify any distinctive molecular signatures in MMC and IMC. A total of 24 cases were selected (14 MMC and 10 IMC) that underwent surgery between 2014 and 2021 without neoadjuvant therapy. From the inclusion of representative material for each case, sections were obtained for the extraction of DNA and RNA. Genetic analysis was performed using the TruSight Oncology 500 kit (Illumina, Inc), which examines mutations in 523 DNA genes and 55 RNA genes. In comparing the two subtypes, the Tumor Mutational Burden (TMB) was significantly higher in MMC (p < 0.01), while no difference was observed in microsatellite instability. MMC exhibited a higher number of pathogenic variants, with a prevalence of variants in TP53, ARID1A/B, ARID2, ERBB2/3, FGFR genes (p < 0.01). Furthermore, MMC showed a higher rate of amplification (p < 0.01), particularly affecting the oncogenes MYC and BRCA2. Overall, these data support the hypothesis that MMC and IMC are neoplasms with different molecular signatures. In progress is a bioinformatic evaluation and assessment of gene fusion products to refine the molecular signature of these neoplasms.