Sequenziamento Completo dell'Esoma nel Disturbo dello Spettro Autistico: Dati Preliminari

Abstract

INTRODUZIONE. Il disturbo dello spettro autistico, come condizione patologica complessa ed eterogenea, presenta una forte influenza genetica. Il progetto di ricerca si propone di identificare, attraverso l'utilizzo della tecnologia del sequenziamento completo dell'esoma, le possibili varianti interconnesse, direttamente o meno, con questo disturbo e di confrontarle, ove possibile, con il fenotipo espresso dal paziente.

MATERIALI E METODI. La ricerca è nata da una collaborazione tra l'Ospedale Gaslini di Genova (Unità di Neuropsichiatria Infantile e Genetica Medica) e l'Istituto Italiano di Tecnologia (IIT). Il campione preso in esame si compone di un totale di 68 pazienti affetti da ASD, di cui solo 34 sono stati analizzati completamente dal punto di vista genetico. Il reclutamento è composto da 5 femmine e 29 maschi, con età compresa tra 4 e 43 anni (età media 11,84 anni).

RISULTATI. È stata osservata la presenza di 12 possibili varianti deleterie rare, la presenza di ulteriori 6 varianti che coinvolgono geni localizzati sul cromosoma X o geni coinvolti in diverse vie neurotrasmettitoriali e anche la presenza di 2 varianti sindromiche gravi.

CONCLUSIONI. L'analisi e lo studio che abbiamo eseguito per dare priorità alle varianti osservate secondo la loro rilevanza putativa al fenotipo del probando ci ha permesso di evidenziare sia gli individui con una singola variante ad alta penetranza che gli individui con una variante multipla a bassa penetranza che concorrono a caratterizzare il fenotipo. Infine, dagli studi di entrambe le tecnologie WES e WGS, stiamo imparando di più sulla complessità genetica coinvolta nel disturbo dello spettro autistico per creare, in futuro, un collegamento diretto con uno specifico fenotipo correlato.

INTRODUCTION. Autism spectrum disorder, as a complex and heterogeneous pathological condition, has a strong genetic influence. The research project purpose to identify, by using complete exome sequencing technology, presumed variants interconnected, directly or not, with this disorder and to compare them, where possible, with the phenotype expressed by the patient.

MATERIALS AND METHODS. The research was born through a collaboration between Gaslini Hospital in Genoa (Child Neuropsychiatry and Genetic Medical unit) and the Italian Institute of Technology (IIT). It aimed to recruit a total of 68 patients affected by ASD, of whom only 34 patients were completely analyzed from a genetic point of view. The enlistment is composed by 5 females and 29 males, age ranged between 4 and 43 years (mean age 11,84 years).

RESULTS. It was observed the presence of 12 possible rare deleterious variants, the presence of a further 6 variants involving genes located on the X chromosome or genes involved in different neurotransmitter pathways and also the presence of 2 severe syndromic variants.

CONCLUSION. The analysis and the study we performed to prioritize the detected variants according to their putative relevance to the proband phenotype allowed us to evidence both individuals with a single high penetrance variant and individuals with a multiple low penetrance variant co-occurring the phenotype. Finally, from studies of both WES and WGS technologies, we are learning more about the genetic complexity involved in ASD to create, in the future, a direct link to a specific related-phenotype.